Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC0.85□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C1orf61Q13536 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.6 ms