Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PICALMQ13492 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PICALMQ13492 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PICALMQ13492 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PICALMQ13492 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PICALMQ13492 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PICALMQ13492 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PICALMQ13492 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PICALMQ13492 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PICALMQ13492 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PICALMQ13492 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PICALMQ13492 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PICALMQ13492 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PICALMQ13492 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PICALMQ13492 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PICALMQ13492 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PICALMQ13492 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PICALMQ13492 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PICALMQ13492 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PICALMQ13492 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PICALMQ13492 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PICALMQ13492 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PICALMQ13492 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PICALMQ13492 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PICALMQ13492 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PICALMQ13492 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PICALMQ13492 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PICALMQ13492 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PICALMQ13492 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PICALMQ13492 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PICALMQ13492 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
PICALMQ13492 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PICALMQ13492 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PICALMQ13492 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PICALMQ13492 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PICALMQ13492 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PICALMQ13492 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PICALMQ13492 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PICALMQ13492 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PICALMQ13492 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PICALMQ13492 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PICALMQ13492 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PICALMQ13492 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PICALMQ13492 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms