Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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TCIRG1Q13488 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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TCIRG1Q13488 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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TCIRG1Q13488 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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TCIRG1Q13488 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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TCIRG1Q13488 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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TCIRG1Q13488 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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