Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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