Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
LSAMPQ13449 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
LSAMPQ13449 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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