Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CLN3Q13286 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CLN3Q13286 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
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