Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
SEMA3BQ13214 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEMA3BQ13214 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
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