Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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RPA4Q13156 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC0.99□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.99□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RPA4Q13156 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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