Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CALCOCO2Q13137 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CALCOCO2Q13137 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CALCOCO2Q13137 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CALCOCO2Q13137 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CALCOCO2Q13137 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CALCOCO2Q13137 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CALCOCO2Q13137 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CALCOCO2Q13137 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CALCOCO2Q13137 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CALCOCO2Q13137 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CALCOCO2Q13137 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CALCOCO2Q13137 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CALCOCO2Q13137 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
CALCOCO2Q13137 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CALCOCO2Q13137 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CALCOCO2Q13137 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CALCOCO2Q13137 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CALCOCO2Q13137 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CALCOCO2Q13137 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CALCOCO2Q13137 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CALCOCO2Q13137 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CALCOCO2Q13137 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CALCOCO2Q13137 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CALCOCO2Q13137 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CALCOCO2Q13137 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CALCOCO2Q13137 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CALCOCO2Q13137 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CALCOCO2Q13137 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CALCOCO2Q13137 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CALCOCO2Q13137 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CALCOCO2Q13137 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CALCOCO2Q13137 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.6 ms