Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PPFIA1Q13136 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PPFIA1Q13136 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.4 ms