Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TRAF1Q13077 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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