Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
MKRN3Q13064 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
MKRN3Q13064 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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