Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CNTN1Q12860 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.5 ms