Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

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Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SCAPQ12770 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCAPQ12770 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SCAPQ12770 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCAPQ12770 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SCAPQ12770 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCAPQ12770 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCAPQ12770 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCAPQ12770 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCAPQ12770 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCAPQ12770 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCAPQ12770 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SCAPQ12770 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCAPQ12770 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCAPQ12770 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SCAPQ12770 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCAPQ12770 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCAPQ12770 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCAPQ12770 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCAPQ12770 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCAPQ12770 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCAPQ12770 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCAPQ12770 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCAPQ12770 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCAPQ12770 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCAPQ12770 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCAPQ12770 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCAPQ12770 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCAPQ12770 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCAPQ12770 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCAPQ12770 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCAPQ12770 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCAPQ12770 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCAPQ12770 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCAPQ12770 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCAPQ12770 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCAPQ12770 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCAPQ12770 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCAPQ12770 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SCAPQ12770 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SCAPQ12770 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SCAPQ12770 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SCAPQ12770 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCAPQ12770 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCAPQ12770 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCAPQ12770 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCAPQ12770 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCAPQ12770 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
SCAPQ12770 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCAPQ12770 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCAPQ12770 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCAPQ12770 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SCAPQ12770 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SCAPQ12770 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SCAPQ12770 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCAPQ12770 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCAPQ12770 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCAPQ12770 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCAPQ12770 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCAPQ12770 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCAPQ12770 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCAPQ12770 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCAPQ12770 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCAPQ12770 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCAPQ12770 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCAPQ12770 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCAPQ12770 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCAPQ12770 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCAPQ12770 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCAPQ12770 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCAPQ12770 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCAPQ12770 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCAPQ12770 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SCAPQ12770 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCAPQ12770 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCAPQ12770 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SCAPQ12770 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SCAPQ12770 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SCAPQ12770 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SCAPQ12770 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
SCAPQ12770 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCAPQ12770 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCAPQ12770 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCAPQ12770 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCAPQ12770 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCAPQ12770 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCAPQ12770 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCAPQ12770 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCAPQ12770 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCAPQ12770 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SCAPQ12770 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SCAPQ12770 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SCAPQ12770 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SCAPQ12770 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCAPQ12770 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCAPQ12770 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCAPQ12770 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCAPQ12770 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCAPQ12770 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SCAPQ12770 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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