Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CTIFO43310 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CTIFO43310 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CTIFO43310 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CTIFO43310 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CTIFO43310 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CTIFO43310 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CTIFO43310 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CTIFO43310 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CTIFO43310 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CTIFO43310 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CTIFO43310 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CTIFO43310 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CTIFO43310 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CTIFO43310 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CTIFO43310 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CTIFO43310 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CTIFO43310 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CTIFO43310 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CTIFO43310 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CTIFO43310 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CTIFO43310 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CTIFO43310 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CTIFO43310 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CTIFO43310 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CTIFO43310 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CTIFO43310 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CTIFO43310 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CTIFO43310 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CTIFO43310 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CTIFO43310 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CTIFO43310 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CTIFO43310 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CTIFO43310 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CTIFO43310 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CTIFO43310 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CTIFO43310 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CTIFO43310 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CTIFO43310 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CTIFO43310 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CTIFO43310 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CTIFO43310 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CTIFO43310 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CTIFO43310 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CTIFO43310 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CTIFO43310 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CTIFO43310 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CTIFO43310 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CTIFO43310 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CTIFO43310 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CTIFO43310 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CTIFO43310 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CTIFO43310 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CTIFO43310 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CTIFO43310 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CTIFO43310 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CTIFO43310 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CTIFO43310 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CTIFO43310 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CTIFO43310 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CTIFO43310 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CTIFO43310 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CTIFO43310 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CTIFO43310 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CTIFO43310 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CTIFO43310 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CTIFO43310 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CTIFO43310 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CTIFO43310 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CTIFO43310 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CTIFO43310 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CTIFO43310 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CTIFO43310 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CTIFO43310 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CTIFO43310 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CTIFO43310 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CTIFO43310 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CTIFO43310 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CTIFO43310 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CTIFO43310 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CTIFO43310 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CTIFO43310 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CTIFO43310 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CTIFO43310 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CTIFO43310 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CTIFO43310 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CTIFO43310 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CTIFO43310 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CTIFO43310 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CTIFO43310 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CTIFO43310 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CTIFO43310 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CTIFO43310 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CTIFO43310 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CTIFO43310 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CTIFO43310 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CTIFO43310 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CTIFO43310 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CTIFO43310 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CTIFO43310 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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