Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RFXAPO00287 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RFXAPO00287 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RFXAPO00287 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RFXAPO00287 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RFXAPO00287 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RFXAPO00287 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RFXAPO00287 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RFXAPO00287 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RFXAPO00287 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RFXAPO00287 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RFXAPO00287 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RFXAPO00287 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RFXAPO00287 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RFXAPO00287 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RFXAPO00287 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RFXAPO00287 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RFXAPO00287 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
RFXAPO00287 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RFXAPO00287 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RFXAPO00287 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RFXAPO00287 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RFXAPO00287 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RFXAPO00287 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RFXAPO00287 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RFXAPO00287 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RFXAPO00287 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RFXAPO00287 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RFXAPO00287 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RFXAPO00287 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RFXAPO00287 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RFXAPO00287 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RFXAPO00287 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RFXAPO00287 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
RFXAPO00287 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RFXAPO00287 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
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