Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
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RABGEF1Q9UJ41 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
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RABGEF1Q9UJ41 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RABGEF1Q9UJ41 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
RABGEF1Q9UJ41 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
RABGEF1Q9UJ41 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
RABGEF1Q9UJ41 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
RABGEF1Q9UJ41 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
RABGEF1Q9UJ41 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
RABGEF1Q9UJ41 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
RABGEF1Q9UJ41 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RABGEF1Q9UJ41 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
RABGEF1Q9UJ41 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
RABGEF1Q9UJ41 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RABGEF1Q9UJ41 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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RABGEF1Q9UJ41 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RABGEF1Q9UJ41 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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RABGEF1Q9UJ41 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
RABGEF1Q9UJ41 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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RABGEF1Q9UJ41 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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RABGEF1Q9UJ41 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
RABGEF1Q9UJ41 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
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RABGEF1Q9UJ41 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
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RABGEF1Q9UJ41 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
RABGEF1Q9UJ41 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RABGEF1Q9UJ41 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
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RABGEF1Q9UJ41 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RABGEF1Q9UJ41 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RABGEF1Q9UJ41 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RABGEF1Q9UJ41 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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