Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GPA33Q99795 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GPA33Q99795 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
GPA33Q99795 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GPA33Q99795 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GPA33Q99795 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GPA33Q99795 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GPA33Q99795 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GPA33Q99795 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GPA33Q99795 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GPA33Q99795 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GPA33Q99795 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
GPA33Q99795 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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GPA33Q99795 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GPA33Q99795 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
GPA33Q99795 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GPA33Q99795 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GPA33Q99795 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GPA33Q99795 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GPA33Q99795 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
GPA33Q99795 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC0.95□□□□□ -2.26
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GPA33Q99795 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GPA33Q99795 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GPA33Q99795 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
GPA33Q99795 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GPA33Q99795 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GPA33Q99795 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GPA33Q99795 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GPA33Q99795 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GPA33Q99795 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GPA33Q99795 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GPA33Q99795 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GPA33Q99795 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GPA33Q99795 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GPA33Q99795 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GPA33Q99795 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
GPA33Q99795 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GPA33Q99795 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
GPA33Q99795 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GPA33Q99795 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GPA33Q99795 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GPA33Q99795 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GPA33Q99795 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GPA33Q99795 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GPA33Q99795 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC0.93□□□□□ -2.26
GPA33Q99795 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GPA33Q99795 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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GPA33Q99795 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GPA33Q99795 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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GPA33Q99795 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GPA33Q99795 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GPA33Q99795 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
GPA33Q99795 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
GPA33Q99795 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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