Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.2 ms