Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRNQ16849 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms