Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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