Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
STX1AQ16623 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
STX1AQ16623 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
STX1AQ16623 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
STX1AQ16623 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
STX1AQ16623 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
STX1AQ16623 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
STX1AQ16623 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
STX1AQ16623 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
STX1AQ16623 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
STX1AQ16623 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
STX1AQ16623 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
STX1AQ16623 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
STX1AQ16623 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
STX1AQ16623 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
STX1AQ16623 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
STX1AQ16623 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
STX1AQ16623 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
STX1AQ16623 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
STX1AQ16623 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
STX1AQ16623 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
STX1AQ16623 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
STX1AQ16623 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
STX1AQ16623 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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