Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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RPE65Q16518 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RPE65Q16518 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPE65Q16518 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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