Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PKN1Q16512 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PKN1Q16512 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PKN1Q16512 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PKN1Q16512 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PKN1Q16512 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PKN1Q16512 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PKN1Q16512 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PKN1Q16512 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PKN1Q16512 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PKN1Q16512 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PKN1Q16512 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PKN1Q16512 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PKN1Q16512 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PKN1Q16512 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PKN1Q16512 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PKN1Q16512 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PKN1Q16512 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKN1Q16512 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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