Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
USF2Q15853 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
USF2Q15853 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
USF2Q15853 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC0.18□□□□□ -2.38
USF2Q15853 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
USF2Q15853 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
USF2Q15853 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
USF2Q15853 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC0.18□□□□□ -2.38
USF2Q15853 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
USF2Q15853 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
USF2Q15853 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
USF2Q15853 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
USF2Q15853 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
USF2Q15853 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
USF2Q15853 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
USF2Q15853 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
USF2Q15853 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
USF2Q15853 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
USF2Q15853 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
USF2Q15853 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
USF2Q15853 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
USF2Q15853 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
USF2Q15853 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
USF2Q15853 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
USF2Q15853 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
USF2Q15853 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
USF2Q15853 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
USF2Q15853 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
USF2Q15853 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
USF2Q15853 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
USF2Q15853 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
USF2Q15853 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
USF2Q15853 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
USF2Q15853 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
USF2Q15853 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
USF2Q15853 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.17□□□□□ -2.38
USF2Q15853 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
USF2Q15853 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
USF2Q15853 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
USF2Q15853 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
USF2Q15853 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
USF2Q15853 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
USF2Q15853 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
USF2Q15853 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
USF2Q15853 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
USF2Q15853 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
USF2Q15853 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
USF2Q15853 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC0.16□□□□□ -2.38
USF2Q15853 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
USF2Q15853 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
USF2Q15853 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
USF2Q15853 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
USF2Q15853 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
USF2Q15853 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
USF2Q15853 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC0.15□□□□□ -2.39
USF2Q15853 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
USF2Q15853 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
USF2Q15853 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
USF2Q15853 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
USF2Q15853 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
USF2Q15853 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
USF2Q15853 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
USF2Q15853 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
USF2Q15853 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
USF2Q15853 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
USF2Q15853 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
USF2Q15853 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
USF2Q15853 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
USF2Q15853 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
USF2Q15853 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
USF2Q15853 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
USF2Q15853 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
USF2Q15853 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
USF2Q15853 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
USF2Q15853 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
USF2Q15853 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
USF2Q15853 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
USF2Q15853 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
USF2Q15853 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
USF2Q15853 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
USF2Q15853 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
USF2Q15853 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
USF2Q15853 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
USF2Q15853 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
USF2Q15853 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
USF2Q15853 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
USF2Q15853 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
USF2Q15853 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
USF2Q15853 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
USF2Q15853 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
USF2Q15853 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
USF2Q15853 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
USF2Q15853 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
USF2Q15853 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
USF2Q15853 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
USF2Q15853 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
USF2Q15853 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
USF2Q15853 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC0.13□□□□□ -2.39
USF2Q15853 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
USF2Q15853 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
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