Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HERC3Q15034 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
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