Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.24□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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