Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NCAPHQ15003 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NCAPHQ15003 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NCAPHQ15003 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NCAPHQ15003 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NCAPHQ15003 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NCAPHQ15003 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NCAPHQ15003 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NCAPHQ15003 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
NCAPHQ15003 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
NCAPHQ15003 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NCAPHQ15003 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NCAPHQ15003 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NCAPHQ15003 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NCAPHQ15003 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NCAPHQ15003 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NCAPHQ15003 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NCAPHQ15003 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NCAPHQ15003 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NCAPHQ15003 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NCAPHQ15003 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NCAPHQ15003 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NCAPHQ15003 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NCAPHQ15003 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NCAPHQ15003 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NCAPHQ15003 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NCAPHQ15003 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NCAPHQ15003 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NCAPHQ15003 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NCAPHQ15003 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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