Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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RAB39AQ14964 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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RAB39AQ14964 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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RAB39AQ14964 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
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RAB39AQ14964 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
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RAB39AQ14964 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB39AQ14964 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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