Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.61□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RFTN1Q14699 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RFTN1Q14699 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RFTN1Q14699 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RFTN1Q14699 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RFTN1Q14699 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RFTN1Q14699 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RFTN1Q14699 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RFTN1Q14699 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RFTN1Q14699 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RFTN1Q14699 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RFTN1Q14699 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RFTN1Q14699 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RFTN1Q14699 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RFTN1Q14699 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RFTN1Q14699 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RFTN1Q14699 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RFTN1Q14699 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RFTN1Q14699 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RFTN1Q14699 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RFTN1Q14699 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RFTN1Q14699 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RFTN1Q14699 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RFTN1Q14699 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RFTN1Q14699 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RFTN1Q14699 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RFTN1Q14699 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RFTN1Q14699 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RFTN1Q14699 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RFTN1Q14699 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RFTN1Q14699 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RFTN1Q14699 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RFTN1Q14699 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RFTN1Q14699 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RFTN1Q14699 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RFTN1Q14699 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RFTN1Q14699 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RFTN1Q14699 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RFTN1Q14699 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RFTN1Q14699 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RFTN1Q14699 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RFTN1Q14699 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RFTN1Q14699 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RFTN1Q14699 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RFTN1Q14699 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RFTN1Q14699 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms