Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SMC1AQ14683 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SMC1AQ14683 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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