Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
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