| CSHL1 | Q14406 | U4.1-201 | ENST00000620349 | 87 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | U6.104-201 | ENST00000637979 | 90 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | ZNF451-208 | ENST00000491832 | 3632 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | SLC25A46-204 | ENST00000504098 | 2345 nt | TSL 5 BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | PRKD3-201 | ENST00000234179 | 5900 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | TAB2-205 | ENST00000538427 | 4240 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AL356292.1-201 | ENST00000283110 | 373 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | MT-CO2-201 | ENST00000361739 | 684 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | RNA5SP276-201 | ENST00000362580 | 94 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | RNU1-22P-201 | ENST00000363334 | 158 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
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| CSHL1 | Q14406 | LINC01594-201 | ENST00000445083 | 611 nt | TSL 5 BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |
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| CSHL1 | Q14406 | AL391987.6-201 | ENST00000305671 | 199 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | Y_RNA.452-201 | ENST00000384202 | 108 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
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| CSHL1 | Q14406 | Y_RNA.556-201 | ENST00000384677 | 113 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
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| CSHL1 | Q14406 | AC008413.1-201 | ENST00000511864 | 177 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | SERF1AP1-201 | ENST00000514575 | 187 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
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| CSHL1 | Q14406 | RPL21P9-201 | ENST00000556149 | 474 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | SNORD53-201 | ENST00000579969 | 78 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
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| CSHL1 | Q14406 | AC037487.3-201 | ENST00000606668 | 112 nt | BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AC135050.6-201 | ENST00000610813 | 528 nt | TSL 3 BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | KIF20B-202 | ENST00000371728 | 6419 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | SCN7A-201 | ENST00000409855 | 7183 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.11 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | OR5M1-202 | ENST00000641076 | 4302 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | PCDH11Y-203 | ENST00000362095 | 4220 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | SNORA25.1-201 | ENST00000362326 | 128 nt | BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | Y_RNA.193-201 | ENST00000363979 | 102 nt | BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | Y_RNA.288-201 | ENST00000364854 | 92 nt | BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | RNU6-117P-201 | ENST00000365415 | 107 nt | BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | LINC00583-201 | ENST00000381010 | 387 nt | TSL 2 BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | SNORD116-13-201 | ENST00000384408 | 92 nt | BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | MIR515-2-201 | ENST00000384883 | 83 nt | BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | MIR515-1-201 | ENST00000384884 | 83 nt | BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AL355497.1-201 | ENST00000406262 | 551 nt | BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | RNU6-710P-201 | ENST00000410424 | 105 nt | BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
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| CSHL1 | Q14406 | AL583859.1-201 | ENST00000455871 | 335 nt | TSL 3 BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
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| CSHL1 | Q14406 | AC073413.2-201 | ENST00000604332 | 360 nt | BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AC069114.2-201 | ENST00000604699 | 304 nt | BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | CSNK1G3-202 | ENST00000360683 | 4047 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.1 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | ZNF702P-202 | ENST00000434269 | 1966 nt | BASIC | 2.09 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | THOC2-216 | ENST00000491737 | 4452 nt | TSL 5 BASIC | 2.09 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | RNA5SP160-201 | ENST00000364866 | 120 nt | BASIC | 2.09 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | RNU6-702P-201 | ENST00000364982 | 107 nt | BASIC | 2.09 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | RNU6-514P-201 | ENST00000384208 | 107 nt | BASIC | 2.09 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | RNU6-136P-201 | ENST00000384663 | 107 nt | BASIC | 2.09 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AL356320.1-201 | ENST00000429616 | 163 nt | BASIC | 2.09 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AL021397.1-201 | ENST00000451806 | 248 nt | BASIC | 2.09 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | RNU6-717P-201 | ENST00000459076 | 104 nt | BASIC | 2.09 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AC090255.1-201 | ENST00000495779 | 349 nt | BASIC | 2.09 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AL163195.1-201 | ENST00000496941 | 348 nt | BASIC | 2.09 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AC097501.2-201 | ENST00000502668 | 305 nt | TSL 5 BASIC | 2.09 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AC084364.2-201 | ENST00000546924 | 395 nt | BASIC | 2.09 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AC078899.2-201 | ENST00000595282 | 212 nt | BASIC | 2.09 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | U1.36-201 | ENST00000620684 | 176 nt | BASIC | 2.09 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | MGAT4C-207 | ENST00000552808 | 1937 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 2.09 | □□□□□ -2.08 | | |
| CSHL1 | Q14406 | CGGBP1-202 | ENST00000398392 | 5298 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.09 | □□□□□ -2.08 | | |
| CSHL1 | Q14406 | RICTOR-202 | ENST00000357387 | 9543 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.09 | □□□□□ -2.08 | | |
| CSHL1 | Q14406 | ZNF644-212 | ENST00000621077 | 2056 nt | TSL 5 BASIC | 2.08 | □□□□□ -2.08 | | |
| CSHL1 | Q14406 | ATP11C-202 | ENST00000361648 | 6010 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.08 | □□□□□ -2.08 | | |
| CSHL1 | Q14406 | Y_RNA.341-201 | ENST00000365341 | 102 nt | BASIC | 2.08 | □□□□□ -2.08 | | |
| CSHL1 | Q14406 | RNA5SP37-201 | ENST00000365420 | 130 nt | BASIC | 2.08 | □□□□□ -2.08 | | |
| CSHL1 | Q14406 | Y_RNA.518-201 | ENST00000384552 | 113 nt | BASIC | 2.08 | □□□□□ -2.08 | | |
| CSHL1 | Q14406 | RNU6-376P-201 | ENST00000384731 | 106 nt | BASIC | 2.08 | □□□□□ -2.08 | | |
| CSHL1 | Q14406 | RNU6ATAC19P-201 | ENST00000408096 | 110 nt | BASIC | 2.08 | □□□□□ -2.08 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AL162400.2-201 | ENST00000427547 | 157 nt | TSL 3 BASIC | 2.08 | □□□□□ -2.08 | | |