Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CSHL1Q14406 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
CSHL1Q14406 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.08
CSHL1Q14406 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
CSHL1Q14406 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CSHL1Q14406 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
CSHL1Q14406 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CSHL1Q14406 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CSHL1Q14406 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CSHL1Q14406 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CSHL1Q14406 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CSHL1Q14406 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms