Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
GTF2H2Q13888 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.7 ms