Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PKP1Q13835 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PKP1Q13835 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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