Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CUL3Q13618 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CUL3Q13618 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CUL3Q13618 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CUL3Q13618 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CUL3Q13618 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CUL3Q13618 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL3Q13618 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL3Q13618 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL3Q13618 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL3Q13618 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL3Q13618 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL3Q13618 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL3Q13618 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL3Q13618 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL3Q13618 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL3Q13618 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL3Q13618 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL3Q13618 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL3Q13618 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL3Q13618 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL3Q13618 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL3Q13618 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL3Q13618 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL3Q13618 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL3Q13618 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL3Q13618 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL3Q13618 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL3Q13618 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL3Q13618 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL3Q13618 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL3Q13618 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL3Q13618 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL3Q13618 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL3Q13618 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL3Q13618 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL3Q13618 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL3Q13618 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL3Q13618 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL3Q13618 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL3Q13618 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL3Q13618 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL3Q13618 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL3Q13618 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL3Q13618 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL3Q13618 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL3Q13618 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL3Q13618 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL3Q13618 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CUL3Q13618 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
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