Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CUL1Q13616 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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CUL1Q13616 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
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CUL1Q13616 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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CUL1Q13616 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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CUL1Q13616 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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CUL1Q13616 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC1□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1□□□□□ -2.25
CUL1Q13616 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
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