Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PKD2Q13563 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PKD2Q13563 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PKD2Q13563 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PKD2Q13563 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PKD2Q13563 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PKD2Q13563 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PKD2Q13563 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PKD2Q13563 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PKD2Q13563 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PKD2Q13563 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PKD2Q13563 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PKD2Q13563 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PKD2Q13563 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PKD2Q13563 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PKD2Q13563 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PKD2Q13563 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PKD2Q13563 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PKD2Q13563 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PKD2Q13563 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PKD2Q13563 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PKD2Q13563 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PKD2Q13563 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PKD2Q13563 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PKD2Q13563 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PKD2Q13563 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PKD2Q13563 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PKD2Q13563 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PKD2Q13563 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PKD2Q13563 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PKD2Q13563 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PKD2Q13563 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PKD2Q13563 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PKD2Q13563 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PKD2Q13563 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PKD2Q13563 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PKD2Q13563 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PKD2Q13563 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PKD2Q13563 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PKD2Q13563 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PKD2Q13563 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PKD2Q13563 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PKD2Q13563 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PKD2Q13563 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PKD2Q13563 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PKD2Q13563 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PKD2Q13563 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PKD2Q13563 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PKD2Q13563 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PKD2Q13563 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
PKD2Q13563 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PKD2Q13563 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PKD2Q13563 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PKD2Q13563 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PKD2Q13563 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PKD2Q13563 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PKD2Q13563 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PKD2Q13563 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PKD2Q13563 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PKD2Q13563 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PKD2Q13563 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PKD2Q13563 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PKD2Q13563 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PKD2Q13563 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PKD2Q13563 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PKD2Q13563 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PKD2Q13563 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PKD2Q13563 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PKD2Q13563 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PKD2Q13563 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PKD2Q13563 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PKD2Q13563 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PKD2Q13563 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PKD2Q13563 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PKD2Q13563 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PKD2Q13563 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PKD2Q13563 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PKD2Q13563 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PKD2Q13563 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PKD2Q13563 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PKD2Q13563 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PKD2Q13563 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PKD2Q13563 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PKD2Q13563 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PKD2Q13563 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PKD2Q13563 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PKD2Q13563 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PKD2Q13563 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PKD2Q13563 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PKD2Q13563 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PKD2Q13563 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PKD2Q13563 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PKD2Q13563 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PKD2Q13563 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PKD2Q13563 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PKD2Q13563 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PKD2Q13563 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PKD2Q13563 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PKD2Q13563 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PKD2Q13563 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 304.9 ms