Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TCIRG1Q13488 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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