Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXE3Q13461 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXE3Q13461 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXE3Q13461 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
FOXE3Q13461 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
FOXE3Q13461 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
FOXE3Q13461 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
FOXE3Q13461 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
FOXE3Q13461 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
FOXE3Q13461 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
FOXE3Q13461 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
FOXE3Q13461 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXE3Q13461 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXE3Q13461 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXE3Q13461 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXE3Q13461 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXE3Q13461 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
FOXE3Q13461 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXE3Q13461 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXE3Q13461 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXE3Q13461 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXE3Q13461 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXE3Q13461 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXE3Q13461 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXE3Q13461 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXE3Q13461 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXE3Q13461 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXE3Q13461 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXE3Q13461 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXE3Q13461 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
FOXE3Q13461 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXE3Q13461 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
FOXE3Q13461 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
FOXE3Q13461 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
FOXE3Q13461 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
FOXE3Q13461 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
FOXE3Q13461 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXE3Q13461 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXE3Q13461 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXE3Q13461 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXE3Q13461 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXE3Q13461 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
FOXE3Q13461 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXE3Q13461 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
FOXE3Q13461 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXE3Q13461 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXE3Q13461 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXE3Q13461 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXE3Q13461 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXE3Q13461 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXE3Q13461 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXE3Q13461 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
FOXE3Q13461 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXE3Q13461 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXE3Q13461 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXE3Q13461 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
FOXE3Q13461 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
FOXE3Q13461 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXE3Q13461 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
FOXE3Q13461 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
FOXE3Q13461 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
FOXE3Q13461 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXE3Q13461 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXE3Q13461 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXE3Q13461 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXE3Q13461 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXE3Q13461 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXE3Q13461 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXE3Q13461 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXE3Q13461 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXE3Q13461 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXE3Q13461 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
FOXE3Q13461 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXE3Q13461 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXE3Q13461 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXE3Q13461 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
FOXE3Q13461 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
FOXE3Q13461 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
FOXE3Q13461 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXE3Q13461 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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