Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
AP3B2Q13367 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
AP3B2Q13367 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
AP3B2Q13367 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
AP3B2Q13367 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
AP3B2Q13367 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
AP3B2Q13367 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
AP3B2Q13367 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
AP3B2Q13367 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
AP3B2Q13367 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
AP3B2Q13367 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
AP3B2Q13367 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
AP3B2Q13367 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
AP3B2Q13367 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
AP3B2Q13367 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
AP3B2Q13367 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
AP3B2Q13367 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
AP3B2Q13367 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
AP3B2Q13367 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
AP3B2Q13367 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
AP3B2Q13367 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
AP3B2Q13367 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
AP3B2Q13367 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
AP3B2Q13367 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
AP3B2Q13367 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
AP3B2Q13367 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
AP3B2Q13367 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms