Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SP140Q13342 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SP140Q13342 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SP140Q13342 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SP140Q13342 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SP140Q13342 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SP140Q13342 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SP140Q13342 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SP140Q13342 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SP140Q13342 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
SP140Q13342 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SP140Q13342 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SP140Q13342 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SP140Q13342 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SP140Q13342 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SP140Q13342 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SP140Q13342 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SP140Q13342 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SP140Q13342 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SP140Q13342 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SP140Q13342 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SP140Q13342 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SP140Q13342 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SP140Q13342 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SP140Q13342 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SP140Q13342 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SP140Q13342 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SP140Q13342 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SP140Q13342 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SP140Q13342 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SP140Q13342 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SP140Q13342 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SP140Q13342 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SP140Q13342 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SP140Q13342 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SP140Q13342 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SP140Q13342 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SP140Q13342 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SP140Q13342 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SP140Q13342 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SP140Q13342 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SP140Q13342 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SP140Q13342 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SP140Q13342 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SP140Q13342 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SP140Q13342 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SP140Q13342 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SP140Q13342 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SP140Q13342 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SP140Q13342 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SP140Q13342 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SP140Q13342 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SP140Q13342 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SP140Q13342 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SP140Q13342 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SP140Q13342 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SP140Q13342 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SP140Q13342 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SP140Q13342 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SP140Q13342 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SP140Q13342 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SP140Q13342 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SP140Q13342 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SP140Q13342 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SP140Q13342 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SP140Q13342 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SP140Q13342 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SP140Q13342 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SP140Q13342 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SP140Q13342 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SP140Q13342 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SP140Q13342 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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SP140Q13342 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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SP140Q13342 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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SP140Q13342 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SP140Q13342 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SP140Q13342 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SP140Q13342 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SP140Q13342 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SP140Q13342 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SP140Q13342 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SP140Q13342 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SP140Q13342 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SP140Q13342 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SP140Q13342 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SP140Q13342 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SP140Q13342 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SP140Q13342 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SP140Q13342 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SP140Q13342 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SP140Q13342 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SP140Q13342 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SP140Q13342 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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