| SEMA3B | Q13214 | Y_RNA.361-201 | ENST00000365515 | 120 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| SEMA3B | Q13214 | Y_RNA.418-201 | ENST00000384029 | 102 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| SEMA3B | Q13214 | MIR29C-201 | ENST00000385231 | 88 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| SEMA3B | Q13214 | BX510359.4-201 | ENST00000423750 | 193 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| SEMA3B | Q13214 | AC011406.1-201 | ENST00000512440 | 370 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| SEMA3B | Q13214 | RNU6-1041P-201 | ENST00000516254 | 102 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| SEMA3B | Q13214 | RNU2-31P-201 | ENST00000516954 | 155 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| SEMA3B | Q13214 | AC040936.1-201 | ENST00000534543 | 172 nt | TSL 5 BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| SEMA3B | Q13214 | AC023157.2-201 | ENST00000540596 | 141 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| SEMA3B | Q13214 | MIR3169-201 | ENST00000578032 | 83 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| SEMA3B | Q13214 | MIR3145-201 | ENST00000580727 | 82 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| SEMA3B | Q13214 | DEFB117-201 | ENST00000602356 | 141 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| SEMA3B | Q13214 | AC062037.2-201 | ENST00000610137 | 73 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| SEMA3B | Q13214 | MALAT1-207 | ENST00000613376 | 132 nt | TSL 3 BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| SEMA3B | Q13214 | SAGE1-202 | ENST00000370709 | 2879 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| SEMA3B | Q13214 | ASPM-202 | ENST00000367408 | 3747 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| SEMA3B | Q13214 | MIR335-201 | ENST00000362173 | 94 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| SEMA3B | Q13214 | Y_RNA.164-201 | ENST00000363709 | 102 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| SEMA3B | Q13214 | RNU6-326P-201 | ENST00000365480 | 107 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| SEMA3B | Q13214 | SNORA53-201 | ENST00000391141 | 249 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| SEMA3B | Q13214 | HMGN2P39-201 | ENST00000398005 | 273 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| SEMA3B | Q13214 | RNU2-38P-201 | ENST00000410856 | 79 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| SEMA3B | Q13214 | RNU6-1132P-201 | ENST00000459214 | 107 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| SEMA3B | Q13214 | AC079804.2-201 | ENST00000490376 | 200 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| SEMA3B | Q13214 | AC121758.2-201 | ENST00000553271 | 193 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| SEMA3B | Q13214 | AC012433.1-201 | ENST00000588916 | 398 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| SEMA3B | Q13214 | AP000942.3-201 | ENST00000603702 | 160 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| SEMA3B | Q13214 | SKIL-202 | ENST00000413427 | 2702 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| SEMA3B | Q13214 | CAPS2-203 | ENST00000393284 | 3430 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| SEMA3B | Q13214 | AC011124.2-201 | ENST00000518739 | 3222 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| SEMA3B | Q13214 | TAB2-205 | ENST00000538427 | 4240 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| SEMA3B | Q13214 | RNU1-58P-201 | ENST00000362413 | 163 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| SEMA3B | Q13214 | SNORA27.1-201 | ENST00000362604 | 124 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| SEMA3B | Q13214 | RNU6-23P-201 | ENST00000363283 | 107 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| SEMA3B | Q13214 | Y_RNA.124-201 | ENST00000363339 | 93 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| SEMA3B | Q13214 | Y_RNA.136-201 | ENST00000363444 | 102 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| SEMA3B | Q13214 | SNORA67.1-201 | ENST00000364749 | 141 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| SEMA3B | Q13214 | U8.13-201 | ENST00000390842 | 128 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| SEMA3B | Q13214 | SNORA26.9-201 | ENST00000391322 | 122 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| SEMA3B | Q13214 | MIR1253-201 | ENST00000408273 | 105 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| SEMA3B | Q13214 | TTTY16-201 | ENST00000437686 | 192 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| SEMA3B | Q13214 | AL353689.1-201 | ENST00000438895 | 199 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| SEMA3B | Q13214 | SUMO1P2-201 | ENST00000452524 | 304 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| SEMA3B | Q13214 | SERF1AP1-201 | ENST00000514575 | 187 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| SEMA3B | Q13214 | RNU1-104P-201 | ENST00000517280 | 175 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| SEMA3B | Q13214 | SUMO2P18-201 | ENST00000518873 | 252 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| SEMA3B | Q13214 | DISC1FP1-204 | ENST00000563681 | 466 nt | TSL 3 BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| SEMA3B | Q13214 | AC092138.2-201 | ENST00000563811 | 428 nt | TSL 5 BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| SEMA3B | Q13214 | C6orf10-201 | ENST00000375007 | 2125 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | SAMD9L-201 | ENST00000318238 | 7134 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | RNU4-80P-201 | ENST00000363200 | 141 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | Y_RNA.287-201 | ENST00000364853 | 94 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | Y_RNA.401-201 | ENST00000383965 | 117 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | SNORA67.3-201 | ENST00000384366 | 140 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | MIR518A2-201 | ENST00000384966 | 87 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | MIR873-201 | ENST00000401120 | 77 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | RNU2-61P-201 | ENST00000411069 | 191 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | RNA5SP270-201 | ENST00000411361 | 118 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | MTCO1P5-201 | ENST00000433573 | 344 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | HMGN2P34-201 | ENST00000437647 | 269 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | AC005703.2-201 | ENST00000453339 | 343 nt | TSL 2 BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | AL139109.1-201 | ENST00000455491 | 297 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | RNU6-295P-201 | ENST00000516901 | 104 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | AP001001.1-201 | ENST00000532422 | 826 nt | TSL 3 BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | RPL21P9-201 | ENST00000556149 | 474 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | MIR6132-201 | ENST00000622083 | 109 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | MIR338-201 | ENST00000636369 | 67 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | ZNF451-208 | ENST00000491832 | 3632 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | CEP57-213 | ENST00000541150 | 2911 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | Y_RNA.14-201 | ENST00000362415 | 103 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | SNORD114-7-201 | ENST00000362520 | 77 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | snoU2-30.2-201 | ENST00000362805 | 70 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | Y_RNA.140-201 | ENST00000363474 | 103 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | RNU6-417P-201 | ENST00000384712 | 107 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | SNORA40.19-201 | ENST00000390846 | 128 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | MIR1283-2-201 | ENST00000408621 | 87 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | AL513185.1-201 | ENST00000431638 | 162 nt | TSL 5 BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | RPL23AP7-203 | ENST00000449021 | 469 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | ATP5J2P3-201 | ENST00000451550 | 258 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | RNA5SP20-201 | ENST00000515976 | 84 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | SNORA70.12-201 | ENST00000516084 | 153 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | AC107973.1-201 | ENST00000530249 | 576 nt | TSL 4 BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | AC103794.1-201 | ENST00000531763 | 197 nt | TSL 3 BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | AC012435.2-201 | ENST00000562869 | 361 nt | TSL 3 BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | AC037487.3-201 | ENST00000606668 | 112 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | AC006435.5-201 | ENST00000624486 | 112 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | AC245060.5-201 | ENST00000610778 | 3293 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | RNU6-271P-201 | ENST00000363858 | 105 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | Y_RNA.307-201 | ENST00000365022 | 117 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | RNU6-407P-201 | ENST00000365280 | 104 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | Y_RNA.562-201 | ENST00000384695 | 113 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | MIR597-201 | ENST00000384968 | 97 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | RNU11-3P-201 | ENST00000391111 | 133 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | AL117342.1-201 | ENST00000404861 | 406 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | AP000235.1-201 | ENST00000424017 | 479 nt | TSL 3 BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | LINC01766-201 | ENST00000453968 | 362 nt | TSL 3 BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | RPS27P22-201 | ENST00000478056 | 241 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | RNU6-1146P-201 | ENST00000516282 | 102 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | RNU6-191P-201 | ENST00000516295 | 94 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| SEMA3B | Q13214 | RNU7-193P-201 | ENST00000516723 | 65 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |