Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRDNQ13061 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRDNQ13061 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRDNQ13061 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
TRDNQ13061 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRDNQ13061 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRDNQ13061 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRDNQ13061 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.58□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.57□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC0.57□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC0.57□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRDNQ13061 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
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