| FLII | Q13045 | Y_RNA.778-201 | ENST00000620203 | 90 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| FLII | Q13045 | AC132825.6-201 | ENST00000638861 | 357 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| FLII | Q13045 | DMD-203 | ENST00000357033 | 13956 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| FLII | Q13045 | AL035425.3-201 | ENST00000564206 | 4996 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| FLII | Q13045 | KTN1-204 | ENST00000395311 | 4516 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-23P-201 | ENST00000363283 | 107 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-525P-201 | ENST00000363685 | 104 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| FLII | Q13045 | RNA5SP493-201 | ENST00000364115 | 91 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-1080P-201 | ENST00000383982 | 107 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| FLII | Q13045 | Y_RNA.488-201 | ENST00000384403 | 102 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| FLII | Q13045 | BMS1P22-201 | ENST00000414726 | 313 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| FLII | Q13045 | SNORD116-25-201 | ENST00000516517 | 92 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| FLII | Q13045 | AC090138.1-201 | ENST00000524493 | 578 nt | TSL 4 BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| FLII | Q13045 | CYCSP26-201 | ENST00000534107 | 320 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| FLII | Q13045 | AL031274.2-201 | ENST00000599419 | 203 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| FLII | Q13045 | AL353149.1-201 | ENST00000610667 | 244 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
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| FLII | Q13045 | LINC01359-207 | ENST00000634799 | 487 nt | TSL 5 BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| FLII | Q13045 | ADGRG4-203 | ENST00000394143 | 9931 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-704P-201 | ENST00000364162 | 103 nt | BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| FLII | Q13045 | SNORA8-201 | ENST00000384574 | 139 nt | BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
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| FLII | Q13045 | RN7SKP101-201 | ENST00000411376 | 320 nt | BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
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| FLII | Q13045 | DSCR8-208 | ENST00000614538 | 403 nt | APPRIS P5 TSL 5 BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| FLII | Q13045 | GPR22-201 | ENST00000304402 | 2942 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| FLII | Q13045 | FAM35CP-201 | ENST00000554755 | 2470 nt | BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| FLII | Q13045 | HDX-201 | ENST00000297977 | 6200 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| FLII | Q13045 | Y_RNA.267-201 | ENST00000364679 | 109 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| FLII | Q13045 | Y_RNA.521-201 | ENST00000384560 | 114 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| FLII | Q13045 | SNORA46-201 | ENST00000384762 | 135 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| FLII | Q13045 | LINC02041-201 | ENST00000440726 | 246 nt | TSL 5 BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-1291P-201 | ENST00000516591 | 104 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| FLII | Q13045 | DNAJC19P2-201 | ENST00000593340 | 302 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| FLII | Q13045 | AL021368.2-201 | ENST00000606125 | 5352 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| FLII | Q13045 | WWP1-201 | ENST00000265428 | 3362 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| FLII | Q13045 | AC100821.1-201 | ENST00000523153 | 2479 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| FLII | Q13045 | KBTBD3-207 | ENST00000534815 | 3396 nt | TSL 5 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-199P-201 | ENST00000362954 | 107 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | Y_RNA.215-201 | ENST00000364204 | 112 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-805P-201 | ENST00000365643 | 106 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | SNORD37.2-201 | ENST00000391075 | 66 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | RNA5SP293-201 | ENST00000410527 | 113 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | AC063976.3-201 | ENST00000426849 | 329 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | AC018634.1-201 | ENST00000437554 | 401 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | EIF4BP1-201 | ENST00000554881 | 351 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | AL033523.1-201 | ENST00000605153 | 153 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | AC027045.1-201 | ENST00000609065 | 202 nt | TSL 5 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | AC022202.1-201 | ENST00000613515 | 211 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | FAM184A-202 | ENST00000352896 | 3700 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | VSTM2A-OT1-201 | ENST00000456049 | 3031 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | CACNB4-222 | ENST00000636350 | 7654 nt | TSL 5 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | SLC8A1-207 | ENST00000406785 | 20987 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | NEB-204 | ENST00000409198 | 20637 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 3.76 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-862P-201 | ENST00000362804 | 105 nt | BASIC | 3.76 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | SNORD45.3-201 | ENST00000363836 | 72 nt | BASIC | 3.76 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | MIR515-2-201 | ENST00000384883 | 83 nt | BASIC | 3.76 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | MIR515-1-201 | ENST00000384884 | 83 nt | BASIC | 3.76 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | LINC02532-205 | ENST00000430094 | 628 nt | TSL 5 BASIC | 3.76 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | LINC01073-201 | ENST00000441659 | 149 nt | TSL 3 BASIC | 3.76 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | RNU7-121P-201 | ENST00000516604 | 62 nt | BASIC | 3.76 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | RNU7-128P-201 | ENST00000517247 | 62 nt | BASIC | 3.76 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | MIR6079-201 | ENST00000635807 | 62 nt | BASIC | 3.76 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | EPS15-202 | ENST00000371730 | 4736 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.75 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | PKHD1L1-201 | ENST00000378402 | 13076 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.75 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-1209P-201 | ENST00000363655 | 107 nt | BASIC | 3.75 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | SNORA33-201 | ENST00000363664 | 130 nt | BASIC | 3.75 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | RNU4-11P-201 | ENST00000365287 | 132 nt | BASIC | 3.75 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | SNORD50.2-201 | ENST00000365465 | 70 nt | BASIC | 3.75 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | RNA5SP274-201 | ENST00000410484 | 108 nt | BASIC | 3.75 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | EEF1A1P41-201 | ENST00000414667 | 207 nt | BASIC | 3.75 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | AC020743.3-201 | ENST00000440351 | 360 nt | TSL 3 BASIC | 3.75 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | SNRPGP8-201 | ENST00000454064 | 226 nt | BASIC | 3.75 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | AL049873.1-201 | ENST00000480540 | 376 nt | BASIC | 3.75 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | SNORA31.26-201 | ENST00000517250 | 137 nt | BASIC | 3.75 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | PCAT4-201 | ENST00000504263 | 2091 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.75 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | AC018630.2-201 | ENST00000534866 | 2403 nt | BASIC | 3.74 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | PRKACB-207 | ENST00000394838 | 4294 nt | TSL 5 BASIC | 3.74 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | TSGA10-205 | ENST00000410001 | 3036 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.74 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | PRKACB-218 | ENST00000610703 | 4240 nt | TSL 2 BASIC | 3.74 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-1164P-201 | ENST00000364428 | 107 nt | BASIC | 3.74 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | Y_RNA.497-201 | ENST00000384447 | 98 nt | BASIC | 3.74 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | CST2P1-201 | ENST00000425770 | 87 nt | BASIC | 3.74 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | AC091895.1-201 | ENST00000624494 | 256 nt | BASIC | 3.74 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | MIR3658-201 | ENST00000636291 | 56 nt | BASIC | 3.74 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | Y_RNA.111-201 | ENST00000363248 | 100 nt | BASIC | 3.73 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-818P-201 | ENST00000364837 | 108 nt | BASIC | 3.73 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | MIR29C-201 | ENST00000385231 | 88 nt | BASIC | 3.73 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | MIR513C-201 | ENST00000401352 | 84 nt | BASIC | 3.73 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | AL606753.1-201 | ENST00000427435 | 87 nt | BASIC | 3.73 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | AC022018.1-201 | ENST00000430685 | 241 nt | BASIC | 3.73 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | AC091133.1-201 | ENST00000435491 | 483 nt | TSL 3 BASIC | 3.73 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | AC107083.1-201 | ENST00000439643 | 279 nt | BASIC | 3.73 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | UQCRHP3-201 | ENST00000451503 | 251 nt | BASIC | 3.73 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | RN7SL633P-201 | ENST00000488974 | 297 nt | BASIC | 3.73 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-1299P-201 | ENST00000516316 | 100 nt | BASIC | 3.73 | □□□□□ -1.81 | | |
| FLII | Q13045 | GNG2-205 | ENST00000554736 | 569 nt | APPRIS P1 TSL 4 BASIC | 3.73 | □□□□□ -1.81 | | |