Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CSTF3Q12996 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
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