Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TMPOP42166 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TMPOP42166 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TMPOP42166 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TMPOP42166 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TMPOP42166 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TMPOP42166 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TMPOP42166 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TMPOP42166 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TMPOP42166 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
TMPOP42166 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TMPOP42166 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TMPOP42166 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TMPOP42166 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TMPOP42166 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
TMPOP42166 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TMPOP42166 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TMPOP42166 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TMPOP42166 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
TMPOP42166 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TMPOP42166 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
TMPOP42166 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TMPOP42166 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TMPOP42166 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
TMPOP42166 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TMPOP42166 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
TMPOP42166 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
TMPOP42166 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TMPOP42166 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TMPOP42166 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TMPOP42166 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TMPOP42166 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TMPOP42166 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TMPOP42166 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TMPOP42166 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TMPOP42166 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TMPOP42166 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TMPOP42166 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TMPOP42166 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TMPOP42166 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TMPOP42166 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TMPOP42166 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TMPOP42166 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TMPOP42166 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
TMPOP42166 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TMPOP42166 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TMPOP42166 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TMPOP42166 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TMPOP42166 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TMPOP42166 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TMPOP42166 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TMPOP42166 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TMPOP42166 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TMPOP42166 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TMPOP42166 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TMPOP42166 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TMPOP42166 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TMPOP42166 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TMPOP42166 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TMPOP42166 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
TMPOP42166 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TMPOP42166 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TMPOP42166 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TMPOP42166 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TMPOP42166 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TMPOP42166 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
TMPOP42166 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TMPOP42166 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TMPOP42166 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TMPOP42166 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TMPOP42166 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TMPOP42166 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TMPOP42166 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TMPOP42166 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TMPOP42166 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TMPOP42166 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TMPOP42166 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TMPOP42166 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TMPOP42166 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TMPOP42166 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TMPOP42166 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TMPOP42166 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TMPOP42166 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TMPOP42166 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TMPOP42166 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TMPOP42166 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
TMPOP42166 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TMPOP42166 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TMPOP42166 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TMPOP42166 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TMPOP42166 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TMPOP42166 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TMPOP42166 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TMPOP42166 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TMPOP42166 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TMPOP42166 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TMPOP42166 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TMPOP42166 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TMPOP42166 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TMPOP42166 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.3 ms