Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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CLDN9O95484 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CLDN9O95484 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CLDN9O95484 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CLDN9O95484 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CLDN9O95484 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CLDN9O95484 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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CLDN9O95484 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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CLDN9O95484 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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CLDN9O95484 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CLDN9O95484 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
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CLDN9O95484 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
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CLDN9O95484 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CLDN9O95484 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CLDN9O95484 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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CLDN9O95484 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CLDN9O95484 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CLDN9O95484 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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CLDN9O95484 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CLDN9O95484 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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CLDN9O95484 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
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CLDN9O95484 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
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CLDN9O95484 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
CLDN9O95484 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLDN9O95484 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLDN9O95484 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLDN9O95484 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLDN9O95484 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLDN9O95484 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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CLDN9O95484 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLDN9O95484 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLDN9O95484 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLDN9O95484 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLDN9O95484 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLDN9O95484 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLDN9O95484 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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