Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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