Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC-1.19□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC-1.19□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1.2□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC-1.2□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-1.2□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC-1.2□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.22□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SMG1Q96Q15 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC-1.22□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC-1.22□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC-1.22□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
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